Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC6Q16204 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms