Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZIC1Q15915 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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