Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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BRD3Q15059 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRD3Q15059 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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