Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3AQ14563 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3AQ14563 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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