Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IRF5Q13568 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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IRF5Q13568 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF5Q13568 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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