Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NEUROD1Q13562 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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