Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LSAMPQ13449 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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