Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
UBE2V1Q13404 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms