Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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