Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CBX3Q13185 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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