Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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IFT88Q13099 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFT88Q13099 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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