Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRN3Q13033 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms