Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms