Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PTPN13Q12923 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPN13Q12923 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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