Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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