Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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EFEMP1Q12805 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFEMP1Q12805 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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