Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms