Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
KCNA1Q09470 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms