Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP7AQ04656 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms