Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP27A1Q02318 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms