Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DEFA6Q01524 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms