Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCN7AQ01118 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCN7AQ01118 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms