Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKL1Q00532 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKL1Q00532 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms