Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBE2IP63279 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms