Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63132 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms