Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRA2BP62995 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRA2BP62995 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms