Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCCD1P59942 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms