Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF3P57682 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF3P57682 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KLF3P57682 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms