Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HDAC4P56524 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HDAC4P56524 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms