Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAD23AP54725 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms