Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PSMD8P48556 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms