Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms