Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOX11P35716 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOX11P35716 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms