Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN7P35236 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms