Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNCP24863 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCNCP24863 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNCP24863 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms