Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms