Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPREP23469 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPREP23469 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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