Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RPS6KB1P23443 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms