Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCNA2P20248 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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