Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms