Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIP17213 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIP17213 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIP17213 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms