Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms