Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BMP3P12645 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BMP3P12645 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BMP3P12645 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BMP3P12645 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms