Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMC1P11047 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMC1P11047 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms