Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAPPC2BP0DI82 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms