Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC166P0CW27 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC166P0CW27 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms