Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NIPSNAP2O75323 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms