Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LDB2O43679 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms