Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CACNA1GO43497 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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