Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ATMINO43313 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATMINO43313 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ATMINO43313 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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